ゲノム（genome）が遺伝子（gene）全体を指すように、プロテオーム（proteome）とは細胞や生物、組織を構成する蛋白質（protein）全体を意味する言葉です。遺伝子はよく設計図に例えられますが、蛋白質は遺伝子という設計図に書き込まれた情報を生体の中で実際に具体化し、機能させる役割を担っています。

　生体内では、遺伝子だけではなく環境変化や細胞の老化など、多数の要因が複雑に影響し合いながら、合成される蛋白質の種類と量を制御しています。ヒトに限らず、生物の全遺伝子の配列が次々に解明される中で、複雑な生命現象を理解するためには、遺伝子情報を活用しながら、生体の蛋白質全体の状態とその変化を網羅的に解析し、統一して理解するための研究（プロテオミクス）が必要不可欠であるという認識が広まっています。

（2023年4月時点）