外傷や臓器の細菌巣から細菌が流出し血液中に侵入して、無菌であるはずの血液中から細菌が検出される状態のことを菌血症といいます。血液中には種々の殺菌因子や免疫機構が存在し感染防御機能を担っていますが、それらの防御機能が低下したり、血液中に入った細菌がそれらの防御機能を凌駕する感染力を有していると、菌血症が重症化して、全身性の炎症反応を引き起こしてしまう場合があります。これを敗血症といい、菌血症とは区別されます。敗血症を防ぐためには、いち早く血液中の細菌を同定し、抗菌薬投与などの適切な処置をすることが重要です。医療の現場では、血液中の細菌の検出に培養法が用いられていますが、RT-PCR（Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction、逆転写ポリメラーゼ連鎖反応）法を用いることで、迅速に、かつ、より高感度に検出することが可能となります。

（2023年4月時点）