整腸作用とは、おなかの調子を整えることを意味します。もっとも身近に体感できることとして、便秘や下痢などの便通異常を改善することにより、毎日規則正しく便通がある状態を保つことがあげられます。また、おなかの中のビフィズス菌や乳酸菌などの有用菌を増やして、大腸菌やウェルシュ菌などの有害菌を減らすことも整腸作用の一つです。さらに腸内フローラのバランスを改善することで、有害菌がつくる発がん関連物質などの腐敗産物の量を減少させると考えられています。
　プロバイオティクスの中には、このような優れた整腸作用が科学的に証明され、特定保健用食品の関与成分として認められているものがあり、腸内フローラのバランスや腸内環境と便通の状態との関係が注目されています。これらの整腸作用を発現させるには摂取したプロバイオティクスが胃液や胆汁で死なずに、生きて腸まで到達することが必須の条件です。

（2023年4月時点）